Ο Ευστράτιος Ζαφείρης γεννήθηκε στη Λέσβο Έλαβε το πτυχίο του Χημικού Μηχανικού από το Εθνικό Μετσόβειο Πολυτεχνείο το 1977. Από το 1985 εργάστηκε στη Γ.Γ. Δημοσίων Έργων στον τομέα μεγάλων έργων ύδρευσης.
Στην επαγγελματική του διαδρομή μέχρι σήμερα έχει συνεισφέρει από θέσεις ευθύνης στην ανάπτυξη και λειτουργία του Ινστιτούτου Εκπαίδευσης και Επιμόρφωσης του ΤΕΕ, ως σύμβουλος στο υπουργείο Βιομηχανίας και ως μέλος Δ.Σ. εταιρειών. Σήμερα είναι μέλος του Δ.Σ. της ΕΛΠΕ Α.Ε.
Διετέλεσε πρόεδρος του Πανελλήνιου Συνδέσμου Χημικών Μηχανικών (1985-1994) καθώς και εκλεγμένο μέλος στην αντιπροσωπεία του ΤΕΕ.
Εξειδικεύεται στη βιομηχανική πολιτική και ειδικότερα στην παραγωγική ανασυγκρότηση, ανταγωνιστικότητα, καινοτομία και ανάπτυξη της ελληνικής βιομηχανίας.